राष्ट्रीय रासायनिक प्रयोगशाला में संगठनात्मक ढाँचा इस तरह तैयार किया जाता है जिससे आज की आवश्यकताओं और मॉंगों को पूरा किया जा सके । इनमें से कुछ निम्न प्रकार हैं :-

• प्रभाग, यूनिट एवं ग्रूप (प्रतीकात्मक रूप से ऐतिहासिक स्रोतों का विषयवार वर्गीकरण)
• ज्ञान क्षमता (जो अनुसंधान एवं विकास सम्बन्धी स्टाफ का मुख्य क्षेत्र है) तथा संसाधन केन्द्र (सुविधाऍं, विशिष्ट कौशल, संग्रहण आदि विषय)
• व्यवसाय ग्रूप (हमारे औद्योगिक ग्राहकों के व्यापक हितों के संरक्षण हेतु सम्मिलित ग्रूपों का गठन)

यह हमारा लचीला ढाँचा है जिसमें विभिन्न प्रभागों के बहुपक्षीय दलों का समावेश है ताकि हमें प्राप्त होने वाली प्रत्येक चुनौती का सामना किया जा सके ।